圓錐角膜的主要臨床特點即角膜中央或周邊不規(guī)則的變薄。眼部癥狀和角膜的變化跡象取決于疾病的嚴重程度：
 

1.潛伏期（臨床前期）患者與一般近視散光患者沒有差異，地形圖可無異常或疑似圓錐，多因為對側(cè)眼為確診的圓錐角膜而發(fā)現(xiàn)；
 

2.初期患者與一般近視散光患者沒有差異，僅能靠角膜地形圖識別發(fā)現(xiàn)，所以極容易誤診和漏診。
 

3.進展期（此期為重要，直接影響治療方案的制定和疾病結(jié)果，近年來的診斷和治療技術(shù)的進步都集中在此期，但此期在一般書籍的分期中沒有述及，原因是傳統(tǒng)分期尚沒有跟上技術(shù)的不斷發(fā)展）患者不規(guī)則散光明顯，角膜前凸，視力逐漸下降，且戴鏡矯正效果不佳；
 

4.終末期，患者角膜前彈力層破壞，漸層基質(zhì)瘢痕形成，視力差，戴鏡無法矯正，病變局部角膜后彈力層破裂可角膜水腫和進一步前凸，并有角膜破裂風險，如無破裂水腫逐漸消退形成瘢痕。圓錐角膜四個體征，即Munson征、Fleischer環(huán)、Vogt線、急性水腫，曾是以往診斷該病的重要依據(jù)，如今角膜地形圖可在早期明確診斷，所以該四個體征對早期診斷和早期治療并無意義。